1. 

陈东阳

学术博士

2017级

鸡PGC体外培养体系的优化及iPSC诱导分化为生殖细胞的研究

2. 

刘俊丹

学术博士

2017级

狂犬病病毒感染小鼠脑小胶质细胞的固有免疫机制研究

3. 

杨婷

学术博士

2018级

两种卵裂方式胚胎的转录组学分析及CEP55作用的初步研究

4. 

刘灵康

学术博士

2018级

Easi-CRISPR和电穿孔介导的输卵管特异性表达 EGFP-HiBiT转基因鸡研究

5. 

李政达

学术博士

2019级

猪卵泡闭锁过程m6A修饰对颗粒细胞自噬及卵母细胞发育力影响的研究

6. 

覃海媚

学术博士

2019级

采用HSV-TK自杀基因制备不育鸡的研究

7. 

覃梁珊

学术博士

2019级

单细胞转录组联合多组学探讨诱导乳腺上皮细胞的重编程分子路径及机制

8. 

朱思燃

学术博士

2019级

大白猪饲料利用率相关生物标记的挖掘及其机制研究

9. 

王豪

学术博士

2019级

表达报告蛋白的重组SVA病毒的构建与应用以及3D和VP1蛋白核定位信号的鉴定

10. 

董覃婷

学术博士

2019级

猪星状病毒调控 I 型干扰素反应的分子机制研究

11. 

梁颖

专业硕士(全日制)

2019级

富硒乳杆菌的制备及其对沙门氏菌感染三黄鸡的保护作用研究

12. 

蒋佳豪

专业硕士(全日制)

2019级

园香鸡生长发育规律及肉质改良的初步研究

13. 

陈杰燕

学术硕士

2020级

杏鲍菇菌渣搭配牛粪、猪粪好氧堆肥发酵及其对参环毛蚓养殖效果的影响

14. 

娄慧聪

学术硕士

2020级

我国PRRSV流行毒株GP5、M基因的遗传进化分析及其亚单位疫苗的研究

15. 

吴愁

学术硕士

2020级

紫苏醇缓解高脂诱导的肝脏脂质代谢紊乱的作用研究

16. 

吴韬

专业硕士(全日制)

2020级

施氏獭蛤性腺发育组织学、配子发生超微结构研究及形态学分析

17. 

杨凌

专业硕士(全日制)

2020级

钝缀锦蛤在北海、防城港、钦州海区的中培与养成研究

18. 

王乐平

专业硕士(全日制)

2020级

噬菌体vB_SPuM_SP02的分离鉴定及其在种鸡蛋消毒的应用研究

19. 

张传亮

专业硕士(全日制)

2020级

狂犬病病毒G蛋白对小鼠嗜神经致病性初探及其多抗制备

20. 

林森柱

专业硕士(全日制)

2020级

构树多糖对黄曲霉毒素 B1 致雏鸡肝损伤的防治作用

研究生姓名

陈东阳

入学日期

2017年9月

指导教师

陆阳清

论文题目

鸡PGC体外培养体系的优化及iPSC诱导分化为生殖细胞的研究

论文主要研究内容及重要结论（≤300字）：

本研究优化得到高效的gPGC体外扩增培养体系，利用该培养体系，首次在体外培养得到xPGC，并展示了从早期胚胎中分离得到的xPGC的特征。建立了稳定的鸡iPSC的体外培养和诱导分化体系并成功获得了iPSC来源的PGCLC。研究结果为提高PGC介导的基因编辑鸡制备效率奠定了基础，为基因编辑技术的应用和濒危鸟类遗传资源的保存提供了新的细胞来源选择。此外，促进了诱导重编程技术在基因编辑和种质资源保存中的应用，并对进一步完善iPSC诱导产生PGCLC的培养体系以及揭示禽类动物模型在生殖和发育生物学的诸多问题提供理论参考和技术支持。

论文的创新点内容：

1. 本研究优化得到的mKO-F培养体系能够快速高效稳定的分离原代gPGC，并得到转基因后代。该培养体系不仅缩短了体外扩增PGC的时间提高了生产转基因鸡的效率，也对利用PGC恢复濒危鸟类和种质资源保护具有重要意义。

2. 利用mKO-F培养体系首次在体外培养得到xPGC。本研究结果展示了从早期胚胎中分离得到的xPGC的特征，为进一步研究体内早期胚胎PGC的起源和发育提供参考，并为体外发育生物学的研究和基因编辑鸡的生产提供了新的细胞工具。

3. 利用BMP4成功诱导iPSC分化产生了生殖细胞，证实了体外利用iPSC诱导分化产生生殖细胞的可行性。研究结果不仅证明iPSC技术在濒危鸟类基因资源利用及繁殖保护方面具有巨大的潜在价值，也为利用细胞重编程技术从禽类体细胞获得生殖细胞及功能性配子奠定基础。

4. 通过SMART转录组测序我们筛选到一批与PGC形成相关的基因和生物学过程。这些研究结果对进一步完善诱导产生PGCLC培养体系以及揭示禽类动物模型在生殖和发育生物学的诸多问题提供丰富的参考和技术支持。

研究生姓名

刘俊丹

入学日期

 2017 年 09月

指导教师

罗廷荣

论文题目

狂犬病病毒感染小鼠脑小胶质细胞的固有免疫机制研究

论文主要研究内容及重要结论（≤300字）：

论文以狂犬病病毒（RABV）感染小鼠脑小胶质细胞的固有免疫机制为研究内容，建立小鼠脑小胶质细胞分选方法，分析RABV 感染对小胶质细胞存活率和极化的影响，通过RABV 感染小鼠脑小胶质细胞的转录组学研究，明确了感染RABV 的小胶质细胞通过上调炎性细胞因子、趋化因子和代谢产物来抵抗RABV 感染并激活Tlr、Tnf、RIG-I、NOD、NF-κB、MAPK 和Jak-STAT 信号通路，对脑内炎症代谢物的产生影响较小。同时，揭示了Sphk1 可以与RABV M 蛋白互作，Sphk1 可促进RABV 的转录和复制、促进细胞因子分泌和增强固有免疫应答，为更好的解释RABV的致病机制及防治狂犬病的研究提供重要参考。

论文的创新点内容：

（1）建立了磁珠分选方法对脑小胶质细胞的分选（包括M1/M2分选），探索了RABV感染对脑内小胶质细胞极化的影响。

（2）对小鼠感染不同RABV毒株的小胶质细胞进行有参转录组分析，发现小鼠感染RABV是通过小胶质细胞上调炎性细胞因子参与RABV的免疫防御机制和发病机制。

（3）本研究在小鼠脑研究狂犬病病毒致病机制的基础上，进一步探索了在小胶质细胞层面对狂犬病病毒致病性的影响，发现狂犬病病毒感染后小胶质细胞的固有免疫应答明显上调，细胞因子明显上升。

（4）研究进一步证明，Sphk1基因能与RABV M蛋白互作，同时促进病毒的转录与复制和固有免疫应答。

研究生姓名

杨婷

入学日期

2018年 9 月

指导教师

李湘萍

论文题目

两种卵裂方式胚胎的转录组学分析及CEP55作用的初步研究

论文主要研究内容及重要结论（≤300字）：

本研究以猪胚胎为材料，首先比较对称卵裂（Sym）和不对称卵裂（Asy）胚胎发育情况，其次利用Smart-seq2技术分析两种胚胎基因表达差异，筛选关键候选基因。采用上调和下调CEP55基因表达及添加Aurora B抑制剂方式，研究其对猪早期胚胎发育及卵裂的影响。主要结论如下：

Sym和Asy胚胎发育潜能不同，有216个差异表达基因。

CEP55基因在猪主要组织、体外成熟卵母细胞和早期胚胎中均有表达，其mRNA和蛋白水平表达模式在卵母细胞和早期胚胎中基本一致，主要定位于极体和细胞核附近。

下调CEP55基因表达不利于早期胚胎发育，影响纺锤体形成及组装。过表达CEP55基因对Barasertib处理造成的胚胎损伤有一定修复作用，部分纠正纺锤体异常。

CEP55可能通过Aurora B-p53-PLK1-CEP55轴影响纺锤体形成和组装，进而影响胚胎卵裂方式。

论文的创新点内容：

(1) 不同卵裂方式的猪胚胎发育能力不同，对称卵裂和不对称卵裂胚胎的转录水平存在差异。

(2) 首次从转录及蛋白水平较全面了解了CEP55在体外成熟猪卵母细胞及早期胚胎中的表达模式。

(3) 采用正负调控CEP55基因表达方式，首次发现下调CEP55基因表达不利于早期胚胎发育，影响纺锤体形成及组装。过表达CEP55基因对Barasertib造成的胚胎损伤有一定修复作用，部分纠正纺锤体异常。

(4) 初步证明CEP55基因通过Aurora B-p53-PLK1-CEP55轴影响纺锤体形成和组装，进而影响猪胚胎卵裂方式。

研究生姓名

刘灵康

入学日期

2018 年 9 月

指导教师

郑喜邦教授

论文题目

Easi-CRISPR和电穿孔介导的输卵管特异性表达EGFP-HiBiT转基因鸡研究

论文主要研究内容及重要结论（≤300字）：

鸡作为重要的模式动物，因其繁殖时间短、饲养成本低、产蛋率高等特点已被广泛用作生物反应器。通过对OVA基因位点进行转基因或基因组编辑，可以在蛋鸡的鸡蛋蛋白（egg white）中生产药用重组蛋白。然而，传统的CRISPR-HDR敲入效率依旧很低（仅有1%—10%）。本研究应用Easi-CRISPR和电穿孔技术将 EGFP-HiBiT 报告基因敲入鸡OVA基因最后一个编码氨基酸残基与终止密码子之间，在内源性OVA启动子调控下，实现 EGFP-HiBiT 在输卵管组织特异性表达。首先针对OVA位点设计了3条sgRNAs，并用多种方法检测其切割活性，筛选出了活性最高的OVA-sgRNA2；随后，确定了最佳长单链DNA (lssDNA) donor，并利用Easi-CRISPR和电穿孔技术在永生化的鸡输卵管上皮细胞系中检测了EGFP-HiBiT的敲入效率；确定该系统可行之后，将该系统应用于鸡胚中，借助胚胎体腔注射与电穿孔技术，结合换壳培养，实施体内 EGFP-HiBiT 敲入试验，获得了输卵管特异性表达EGFP-HiBiT转基因鸡后代。本文研究工作为利用基因编辑手段生产输卵管特异性表达转基因鸡奠定了理论与技术基础，有助于开展其他禽类基因编辑研究。

论文的创新点内容：

1、外源基因插入位点设计于OVA基因终止密码子上游，在内源性OVA启动子的驱动下，EGFP-HiBiT融合基因表达的同时也不影响自身OVA的表达，保证了基因敲入的安全性。

2、Easi-CRISPR技术首次应用于鸡基因组编辑，且敲入效率远高于传统CRIPSRP-HDR介导的基因敲入。

3、本研究采用的HiBiT blotting更优于传统的Western blotting检测方法，可以更简单、快速地验证HiBiT标记的EGFP表达，同时也缩短了转基因后代筛选时间。

研究生姓名

李政达

入学日期

2019年  9 月

指导教师

陆凤花

论文题目

猪卵泡闭锁过程m6A修饰对颗粒细胞自噬及卵母细胞发育力影响的研究

论文主要研究内容及重要结论（≤300字）：

   本研究首先对猪卵泡闭锁过程颗粒细胞(GCs)、卵母细胞的m6A修饰和细胞自噬变化模式进行分析，发现猪卵泡闭锁过程，GCs及卵母细胞均表现出METTL3水平及m6A修饰水平降低，自噬水平增高的现象。通过转录组学分析发现，自噬相关基因UKL1在健康卵泡与晚期闭锁卵泡GCs中差异表达，且ULK1-3’UTR上存在高置信度m6A修饰位点；进一步的实验证实METTL3介导的m6A修饰可通过调节ULK1的表达，调控GCs细胞自噬，影响GCs的PROG分泌。对卵母细胞的研究发现，猪卵泡闭锁过程，卵泡微环境介导的m6A修饰水平下降会引起卵母细胞自噬水平上升，从而影响卵母细胞的发育。使用甜菜碱处理可提高卵母细胞m6A修饰水平，降低细胞自噬水平，有利于早期闭锁卵泡卵母细胞体外成熟及后续胚胎发育。

论文的创新点内容：

（1）发现了猪卵泡闭锁过程颗粒细胞及卵母细胞m6A修饰、细胞自噬的变化规律，以及m6A修饰对细胞自噬的调控作用，为进一步揭示猪卵泡闭锁的作用机理奠定理论基础。

（2）创新性地从内源性卵泡液微环境外泌体角度，探讨不同闭锁状态卵泡液微环境对颗粒细胞及卵母细胞m6A修饰的影响，并发现闭锁卵泡外泌体可降低颗粒细胞、卵母细胞m6A修饰，并降低卵母细胞发育力。

（3）本研究证实了外源性的m6A供体甜菜碱可改善猪早期闭锁卵泡卵母细胞发育力，为进一步改善母畜繁殖力提供新实验支持和理论依据。

研究生姓名

覃海媚

入学日期

 2019年09 月

指导教师

陆阳清

论文题目

转基因HSV-TK鸡模型的制备与应用研究

论文主要研究内容及重要结论（≤300字）：

（1）利用基因编辑的HSV-TK_PGCs成功制备HSV-TK转基因鸡模型，确认了HSV-TK系统介导的细胞消融在家禽上的的可行性。该研究结果为后续利用HSV-TK不育鸡胚作为受体移植外源PGCs快速获得后代奠定基础，是种质资源保存及转基因模型制备的一种新策略。

（2）利用HSV-TK不育鸡胚为受体移植mCherry_PGCs，获得高效的mCherry转基因后代，充分证明了通过消除受体鸡胚内源的生殖细胞策略可以提高外源生殖细胞的生殖系遗传效率。

（3）我们首次建立了E6.5鸡胚双侧卵巢分化时细胞类群高分辨率图谱，并利用HSV-TK不育鸡模型验证了生殖细胞对卵巢皮质发育和和颗粒细胞的分化不是必需的。为进一步探究性腺细胞发育过程及生殖细胞与体细胞相互作用机制提供重要的研究工具。

论文的创新点内容：

（1）将HSV-TK自杀消融系统应用家禽行业中，并验证其可行性，即表达HSV-TK的体细胞和生殖细胞均能被GCV底物诱导细胞消融。

（2）利用基因组编辑技术产生HSV-TK不育受体鸡胚，实现供体PGCs的高效种系遗传，从而直接用来生产基因编辑鸡的其他品种或者物种保存。

（3）我们注释了E6.5鸡胚双侧卵巢细胞类群的高分辨率图谱，有助于更好地理解性别分化后脊椎动物卵巢分化的机制。

研究生姓名

覃梁珊

入学日期

2019年09 月

指导教师

黄奔

论文题目

单细胞转录组联合多组学探讨诱导乳腺上皮细胞的重编程分子路径及机制

论文主要研究内容及重要结论（≤300字）：

本研究利用单细胞转录组联合多组学方法绘制了小分子化合物诱导山羊体细胞重编程为乳腺上皮细胞多组学图谱，揭示诱导乳腺上皮细胞重编程的路径和分子机制。主要得到以下结论：

1、诱导乳腺上皮细胞稳定激活上皮维持和乳腺发育的转录网络，甲基化和蛋白代谢模式被重置以适应乳合成调控状态。

2、CiMECs和GMECs高度相似，且具有同质性和安全性。

3、诱导乳腺上皮细胞重编程的路径由多个顺序切换的分子事件组成，其中上皮细胞增殖信号是潜在的重编程细胞分化限速点。

4、主效因子Repsox能迅速激活重编程细胞的乳腺谱系，辅助因子可通调控细胞周期信号和表观遗传修饰因子驱动乳腺上皮细胞分化成熟。

论文的创新点内容：

1、首次绘制了山羊化学诱导乳腺上皮细胞的多组学图谱。

2、首次证明了山羊化学诱导乳腺上皮细胞与山羊乳腺细胞具有高度相似性和同质性，且未发现致瘤性。

3、首次使用联合转录组学方法重构山羊化学诱导乳腺上皮细胞重编程的分子路线图，并发现重编程细胞的潜在分化限速点。

4、首次对使用不同诱导方案获得的诱导乳腺上皮细胞进行比较，并发现驱动乳腺上皮细胞分化成熟的潜在关键因素。

研究生姓名

朱思燃

入学日期

 2019 年 9 月

指导教师

兰干球 教授

论文题目

大白猪饲料利用率相关生物标记的挖掘及其机制研究

论文主要研究内容及重要结论（≤300字）：

该论文采用TMT蛋白组学、多重PCR技术、代谢组学和蛋白-代谢组联合分析研究了影响大白猪饲料利用率的分子标记，筛选出了3个与饲料利用率相关的候选蛋白标记物，3个与饲料利用率相关的SNPs，并对候选基因AHSG的调控机制进行了初步研究，发现CEBPA能增强该基因启动子活性；利用血清代谢组学分析，筛选出4个与饲料利用率相关的代谢物，并通过蛋白质组和代谢组数据的联合分析筛选获得3个蛋白-代谢物对。研究结果为大白猪饲料利用率的分子育种提供了新的候选遗传标记。

论文的创新点内容：

1、  通过蛋白组学筛选到3个与猪饲料利用率相关的蛋白标记：AHSG、SERPING1和FBLN1。

2、  筛选到3个可作为猪RFI和FCR性状育种的有效遗传标记：AHSG rs706118777、LECT2 rs339463109和SERPING1 rs339330770。

3、  发现AHSG上rs706118777 C→T突变会导致CEBPA结合位点的缺失，降低AHSG的表达，从而影响大白猪的饲料效率。

研究生姓名

王豪

入学日期

 2019 年 9月

指导教师

韦祖樟 教授

论文题目

表达报告蛋白的重组SVA的构建与应用以及SVA 3D和VP1蛋白核定位信号的鉴定

论文主要研究内容及重要结论（≤300字）：

本研究对SVA临床分离毒株SVA CH-GX-01-2018及其感染性克隆拯救病毒（rSVA-GX01）毒株在4周龄的仔猪进行了病毒的致病性分析。结果表明感染性克隆拯救病毒对猪的致病性低于亲本病毒。

本研究基于SVA的感染性克隆pSVA-GX01成功开发了分别表达三种不同报告蛋白（GFP，Gluc，Nluc）的重组报告病毒（rSVA-GFP，rSVA- Gluc，rSVA- Nluc），并初步对重组病毒进行了应用。利用CRISPR Cas9技术对PK-15细胞进行了基因编辑，成功获得了一株稳定敲除SVA细胞受体ANTXR 1的PK-15细胞系，并命名为PK-15-KO，并确定ANTXR 1是PK-15细胞上的SVA受体。

成功鉴定出介导3D蛋白进入细胞核的NLS序列（¹⁴VPRKSKLRKTT²⁴），确定3D蛋白通过核转运蛋白KPNA1、KPNA2、KPNA3、KPNA4和KPNA6进入细胞核。

成功鉴定了VP1蛋白的NLS序列（²³⁰TAVKHVAVYVRYKNARAWCPSMLPFRSYKQK²⁶⁰），并发现VP1蛋白可能是通过importin β2介导VP1进入细胞核。

论文的创新点内容：

1.评估了分离毒株SVA CH-GX-01-2018及其感染性克隆而拯救出的克隆病毒的致病性，发现重组病毒相较于亲本病毒在仔猪上的致病性降低。

2.构建了三种分别表达报告蛋白（GPF，Gluc和Nluc）的重组SVA，生物学特性分析表明，重组病毒与亲本病毒在BHK-21细胞上与亲本病毒具有类似的增殖能力，插入SVA基因组中报告基因在细胞上稳定存在6代，表达的报告蛋白具有生物学活性，报告蛋白活性与病毒滴度正相关。构建了稳定敲除ANTXR 1的PK-15细胞系PK-15-KO，将报告病毒rSVA-GFP用于SVA细胞受体的鉴定；rSVA-Gluc用于抗病毒药物筛选； rSVA-Nluc用于SVA在小鼠上的可视化分析，可视化分析显示在SVA感染早期，SVA主要在小鼠的口鼻及手足部位进行复制。

3.发现SVA 3D蛋白定位于细胞核，界定了3D蛋白的NLS及其介导核定位的关键碱性氨基酸，发现3D蛋白可能通过KPNA1、KPNA2、KPNA3、KPNA4和KPNA6进入细胞核，发现3D NLS突变不影响病毒在BHK-21细胞和ICR小鼠体内的复制能力。

4. 发现VP1蛋白可定位于细胞核，界定了VP1蛋白NLS以及介导蛋白入核的关键碱性氨基酸，VP1蛋白可能依靠importin β2进入细胞核，VP1 NLS突变不影响病毒在BHK-21细胞和小鼠体内的的复制能力。

研究生姓名

董覃婷

入学日期

 2019 年 9月

指导教师

黄伟坚 教授

论文题目

猪星状病毒调控I型干扰素反应的分子机制研究

论文主要研究内容及重要结论（≤300字）：

本研究对猪星状病毒及其非结构蛋白调控免疫反应的作用进行了解析。检测了PAstV-GX1株病毒的生长特性，发现PAstV1感染PK-15细胞中后期后会诱导IFN-β产生，且主要通过IRF3介导的信号通路诱导IFN-β的产生，而不是NF-κB。PAstV1能够激活RLRs信号通路中的RIG-I与MDA5模式识别受体，干扰PK-15细胞中RIG-1和MDA5蛋白的表达后，PAstV1刺激产生的IFN-β表达水平显著降低。

验证了PAstV1 nsP1a/4拮抗IFN-β的产生及其信号传导，且抑制IRF3的启动子活性及其磷酸化修饰并与IRF3相互作用；验证了PAstV1 nsP1a/4存在磷酸化修饰；发现PAstV1 nsP1a/4能够显著抑制RIG-I、MDA-5或MAVS刺激产生的IFN-β启动子活性；发现PAstV1 sP1a/4蛋白能够与MAVS相互作用，相互作用区域是MAVS CARD结构域。通过PAstV1 nsP1a/4基因的截短突变分析发现，PAstV1 nsP1a/4蛋白与MAVS相互作用的主要是其C端区域。

论文的创新点内容：

1.  首次对猪星状病毒感染宿主细胞刺激IFN-β产生的信号通路进行解析，验证了猪星状病毒能够激活RLRs信号通路；验证了PAstV1在PK-15细胞中通过IRF3信号通路诱导IFN-β产生，而不是NF-κB通路；干扰RIG-I/MDA5蛋白表达能促进猪星状病毒的复制。

2.  对猪星状病毒非结构蛋白nsP1a调控IFN-β反应进行探索，首次证实了PAstV1 nsP1a/4能够抑制IFN-β产生及其信号传导；发现了PAstV1 nsP1a/4可能靶向ISGF3抑制IFN-β的信号传导；验证了PAstV1 nsP1a/4能够抑制IRF3激活的IFN-β，且通过与IRF3相互作用抑制IFN-β产生。

3.  验证了PAstV1 nsP1a/4存在磷酸修饰；首次验证了猪星状病毒nsP1a/4蛋白能够靶向MAVS抑制IFN-β的产生，其机制是通过与MAVS的CARD结构域相互作用，从而阻断RIG-I/MDA5对MAVS的信号传导，加深了对nsP1a/4蛋白在猪星状病毒复制方面的理解。